Desa kragan terletak pada bagian Selatan kecamatan gedangan, +/-5 Km dari ibukota kecamatan, +/-8 Km dari ibukota kabupaten sidoarjo dan +/12 Km dari ibukota provinsi jawa timur (Kota Surabaya). desa kragan dapat dituju dengan menempuh jalan darat baik menggunakan kendaraan beroda 2 maupun 4 dari berbagai arah. Dari arah utara melalui jalur pantura melalui kecamatan waru kabupaten sidoarjo, sebelah timur melaui kecamatan sedati serta arah barat melalui kecamatan sukodono. Desa kragan memiliki luas wilayah seluas 73,535 Ha, terdiri dari 2 dusun dengan rukun tetangga sebanyak 8 RT. Secara topografi wilayah desa kragan adalah dataran rendah dengan ketinggian berkisar antara 0-750 m diatas permukaan air laut, dengan suhu udara antara 20℃ -31℃ dengan kelembapan udara berkisar antara 80 – 88% dan curah hujan rata rata 2500-3000 mm/tahun. Sebagaimana umumnya daerah tropis musim hujan berlangsung antara bulan desember samapai dengan bulan juni, sedangkan musim kemarau anatara bulan juli-bulan November.